Theo kết luận điều tra của Cục Hàng hải Việt Nam mà đã báo cáo cho Bộ Giao thông Vận tải, Vinalines Queen bị chìm vì hành trình trong điều kiện thời tiết xấu, nickel trên tàu hóa lỏng làm tàu bị nghiêng. Nhận định của thuyền trưởng về sự cố lại thiếu chính xác nên đã đưa ra những hành động không có hiệu quả khiến tàu chìm.[3]